231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1953 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 322 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  58.33 
 
 		 323 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  57.37 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  57.48 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  58.78 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  50.66 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  50.66 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  50.66 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  49.01 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  51.32 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  49.01 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  49.34 
 
 		 302 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  48.69 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  53.16 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  48.5 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  50.67 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  51.83 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  45.67 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  50.16 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  48.76 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  46.51 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  49.32 
 
 		 350 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  47.47 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  47.92 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  40.06 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  35.81 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  42.01 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  40.55 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  39.87 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  39.36 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.19 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  38.97 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.67 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  32.89 
 
 		 295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  35.19 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.05 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.86 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  32.58 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.94 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.01 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.65 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.44 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  29.68 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.78 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.68 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  29.85 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.32 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.85 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.62 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.13 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.67 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.43 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23.72 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.68 
 
 		 309 aa  92.8  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.42 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  29.48 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  22.76 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.35 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.62 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.39 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  28.81 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.48 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.1 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  24.19 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.95 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.7 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.37 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  28.66 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.74 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.09 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.31 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  30.87 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  25.95 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.9 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.6 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  25.35 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  31.39 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.79 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  29.15 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.51 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  36.14 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.8 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  26.19 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  22.51 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.43 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.95 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  34.82 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25.94 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.94 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  30.63 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>