226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0253 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  587  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  37.55 
 
 
291 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  38.76 
 
 
295 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  32.87 
 
 
288 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  32.62 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  39.91 
 
 
295 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  37.95 
 
 
290 aa  156  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  34.15 
 
 
295 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  31.91 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  31.45 
 
 
287 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  32.44 
 
 
291 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.23 
 
 
290 aa  142  9e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.44 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.67 
 
 
296 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  35.69 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  32.06 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.42 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
296 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.8 
 
 
296 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  32.82 
 
 
295 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  36.59 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.85 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  30.68 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.41 
 
 
329 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  33.59 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 
294 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  32.55 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  33.03 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  34.84 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.59 
 
 
353 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.06 
 
 
363 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.9 
 
 
328 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  30.66 
 
 
325 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  34.86 
 
 
334 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  32.96 
 
 
338 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.52 
 
 
296 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
295 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.64 
 
 
340 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  32.95 
 
 
317 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 
312 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  32.38 
 
 
339 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  34.11 
 
 
331 aa  99  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  32.49 
 
 
325 aa  99  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  32.54 
 
 
331 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  32.59 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  32.54 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  32.06 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28.38 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  34.39 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  33.47 
 
 
350 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  29.74 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  34.23 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  30.43 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  30.43 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  30.43 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  31.42 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29 
 
 
323 aa  86.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  30.15 
 
 
366 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  32.52 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  32.34 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  32.8 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  30.95 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.21 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  32.24 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.04 
 
 
302 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.38 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  28.52 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.59 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.88 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  28.19 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  28.73 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.61 
 
 
317 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  27.86 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  30.11 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.51 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.16 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.29 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.73 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  39.33 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.14 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.24 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  36.84 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  26.79 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  27.55 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  39.33 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  33.58 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  31.48 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.74 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  26.37 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.51 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  27.98 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  43.53 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.95 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  27.27 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>