296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3262 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  42.01 
 
 
309 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  40.14 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  37.46 
 
 
291 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  36.86 
 
 
294 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  38.75 
 
 
296 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  34.13 
 
 
292 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  32.78 
 
 
307 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  36.52 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  32.53 
 
 
306 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  33.89 
 
 
298 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 
303 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  29.76 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  29.7 
 
 
293 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  30.74 
 
 
293 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
303 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  27.49 
 
 
301 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  32.81 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.3 
 
 
287 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.37 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  33.67 
 
 
292 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  26.04 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.86 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  30.45 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  33.03 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  32.99 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.09 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  28.87 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  29.25 
 
 
290 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
296 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  27.09 
 
 
302 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30.95 
 
 
296 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  31 
 
 
288 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.73 
 
 
296 aa  106  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  31.47 
 
 
302 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  32.16 
 
 
309 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.15 
 
 
299 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.18 
 
 
291 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  102  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.82 
 
 
295 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.74 
 
 
295 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  27.85 
 
 
288 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  24.54 
 
 
288 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  26.64 
 
 
303 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.99 
 
 
300 aa  99.4  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.87 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  32.42 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.23 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  31.96 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.85 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.63 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  31.48 
 
 
302 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.95 
 
 
295 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  33.18 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.48 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  27.03 
 
 
304 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  28.51 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  29.87 
 
 
306 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  24.65 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  23.89 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.93 
 
 
291 aa  87  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  34.04 
 
 
436 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  32.69 
 
 
436 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  26.42 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.74 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25.98 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  32.09 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  26.89 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  25.47 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.21 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.98 
 
 
444 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  32.51 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  31.25 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.05 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.06 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  23.36 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  28.16 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.21 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25.18 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25.18 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25.18 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  28.05 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  29.01 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  25.71 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.39 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.36 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.38 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.65 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  37.82 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.62 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>