257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4278 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  631  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  75.59 
 
 
304 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  53.11 
 
 
322 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  50.34 
 
 
298 aa  333  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  45.18 
 
 
309 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  46.56 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  47.19 
 
 
310 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  38.23 
 
 
303 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  34.65 
 
 
309 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  36.45 
 
 
299 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  35.45 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  35.45 
 
 
302 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  35.45 
 
 
302 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  34.88 
 
 
302 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 
306 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.96 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.17 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.65 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  30.11 
 
 
288 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.08 
 
 
291 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.13 
 
 
298 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  26.23 
 
 
296 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
295 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.25 
 
 
290 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.45 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  27.63 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  26.06 
 
 
303 aa  99  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.62 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.94 
 
 
287 aa  97.1  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  24.91 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  24.66 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  29.24 
 
 
291 aa  94  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  23.95 
 
 
291 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.02 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  24.48 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.34 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.57 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.71 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.42 
 
 
295 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  27.74 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  23.81 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.21 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.74 
 
 
287 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.42 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.35 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  27.06 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.05 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  23.23 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  24.37 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.48 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.45 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  24.9 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  30.39 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  23.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.14 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.21 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  23.79 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  24.75 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  27.88 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  28.19 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.86 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  25.26 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.37 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  23.13 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  24.91 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  27.91 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  27.4 
 
 
436 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.7 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  24.91 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  23.13 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  22.92 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  25.91 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  25.12 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  27.56 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  24.02 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.51 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  25.53 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  25.53 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  22.7 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  25.23 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  23.33 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  23.22 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  23.2 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  22.99 
 
 
429 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  23.63 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  27.08 
 
 
447 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  23.27 
 
 
363 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.69 
 
 
450 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.13 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  24.51 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  24.38 
 
 
338 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>