More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02160 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  75.61 
 
 
287 aa  468  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  70.73 
 
 
287 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  55.05 
 
 
287 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  55.05 
 
 
291 aa  345  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  52.07 
 
 
290 aa  329  4e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  46.88 
 
 
292 aa  297  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  45.49 
 
 
295 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  42.31 
 
 
291 aa  267  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  42.66 
 
 
292 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  42.61 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  42.01 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  44.03 
 
 
297 aa  248  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  44.33 
 
 
295 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  43.18 
 
 
309 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  44.98 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  40.58 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  38.24 
 
 
328 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  39.44 
 
 
296 aa  228  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  44.63 
 
 
290 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  38.62 
 
 
295 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  37.23 
 
 
295 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  37.15 
 
 
296 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  37.18 
 
 
295 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  34.98 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.82 
 
 
294 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.74 
 
 
294 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  32.41 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.99 
 
 
329 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.71 
 
 
309 aa  175  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  32.61 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.35 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.94 
 
 
328 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.87 
 
 
287 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.05 
 
 
353 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.38 
 
 
340 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  35.77 
 
 
291 aa  147  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.09 
 
 
328 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  27.76 
 
 
329 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.02 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  26.91 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  29.47 
 
 
302 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  37.86 
 
 
393 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.57 
 
 
317 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.86 
 
 
314 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  28.62 
 
 
317 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.77 
 
 
315 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.77 
 
 
315 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.77 
 
 
315 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  29.37 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  30.15 
 
 
314 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  31.01 
 
 
276 aa  135  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  30.42 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  28.27 
 
 
366 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.86 
 
 
310 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  29.77 
 
 
314 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  32.5 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.55 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  31.25 
 
 
303 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  31.18 
 
 
312 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.03 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  39.51 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  29.77 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.88 
 
 
303 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.36 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  28.24 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  26.86 
 
 
350 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  30.38 
 
 
330 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 
350 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  28.78 
 
 
334 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  27.11 
 
 
338 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.38 
 
 
331 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.77 
 
 
331 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.83 
 
 
292 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  27.36 
 
 
328 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  26.92 
 
 
317 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  28.14 
 
 
329 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  26.62 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  28.17 
 
 
302 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  29.3 
 
 
331 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  29.03 
 
 
339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.98 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  33.18 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  29.27 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  35.71 
 
 
318 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  32.74 
 
 
322 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  26.09 
 
 
418 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.11 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  30.08 
 
 
324 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  25.75 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  33.93 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  28 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  33.93 
 
 
317 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.76 
 
 
293 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  24.63 
 
 
316 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  30.21 
 
 
309 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  33.93 
 
 
317 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  32.54 
 
 
311 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  33.93 
 
 
317 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>