299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2299 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  643    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  70.75 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  69.21 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  64.46 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  64.46 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  64.46 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  65.51 
 
 		 316 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  58.73 
 
 		 310 aa  355  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  61.46 
 
 		 312 aa  352  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  65.16 
 
 		 302 aa  351  8e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  62.54 
 
 		 317 aa  342  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  62.74 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  53.97 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  56.76 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  55.17 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  58.6 
 
 		 311 aa  279  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  54.72 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  56.16 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  54.3 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  54.26 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  52.91 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  50.85 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  52.6 
 
 		 323 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  48.91 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  40.51 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  42.56 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  41.7 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  42.44 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  41.84 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  37.8 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  38.08 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  36.73 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  42.7 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  32.42 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  32.5 
 
 		 291 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  30 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  35.8 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.32 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  36.62 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.97 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  29.3 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  35.69 
 
 		 294 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  32.48 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.59 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.91 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.11 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33.65 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.93 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.9 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.9 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.63 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.86 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.43 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.64 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  34.11 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.14 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.65 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.87 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 		 303 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.07 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.15 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.35 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  32.71 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  34.51 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  27.92 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  26.22 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  31.23 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  32.28 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  26.79 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.2 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.09 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  31.91 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  32.81 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  28.76 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.29 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  33.76 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  32.97 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.17 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  23.17 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  32.58 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  34.3 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.37 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.15 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.58 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.86 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.02 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  31.06 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  30.07 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  31.16 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.36 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  33.47 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  31.91 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  33.47 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  25.78 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  34.14 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>