More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3176 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  47.3 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  43.97 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  47.64 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  47.97 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  47.64 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  39.47 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  39.6 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  36.84 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  35.33 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  33.8 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  30.46 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  34.88 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  31.58 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 295 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  32.97 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  28.52 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  29.29 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.48 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  34.9 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  32 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  30.45 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  30.51 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  34.59 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  32.77 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.99 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.13 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.62 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.33 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  33.46 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.03 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.62 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.4 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  34.68 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.26 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.56 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.49 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  33.09 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  29.45 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  31.75 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.65 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  26.89 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.45 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.26 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.03 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.05 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  27.27 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.46 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  32.42 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  33.05 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  32.08 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.62 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.4 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.86 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  31.41 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  24.32 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.55 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.65 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.83 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.96 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  25.51 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  34.4 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  21.72 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29.27 
 
 		 363 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25.18 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.54 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.54 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  31.98 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.12 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  29.72 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.79 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  31.71 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  36.96 
 
 		 443 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  25.52 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  30.91 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.73 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.44 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  30.97 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.56 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  30.24 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  32.93 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.69 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  32.23 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.28 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.26 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  24.48 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.28 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  29.44 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.59 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.12 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.27 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.28 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.13 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>