153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2627 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  89.78 
 
 
313 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  83.01 
 
 
318 aa  517  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  79.94 
 
 
312 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  77.96 
 
 
310 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  78.07 
 
 
312 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  76.49 
 
 
312 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  60.14 
 
 
324 aa  322  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  50.53 
 
 
304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  50.18 
 
 
304 aa  278  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  48.77 
 
 
304 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  49.48 
 
 
303 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  47.92 
 
 
303 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  47.3 
 
 
308 aa  258  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  47.16 
 
 
309 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  49.66 
 
 
303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  48.39 
 
 
310 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  47.22 
 
 
318 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  45.77 
 
 
306 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  45.29 
 
 
320 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  44.76 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  44.41 
 
 
306 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  44.68 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  48.91 
 
 
312 aa  235  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  41.33 
 
 
303 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  41.02 
 
 
320 aa  198  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  40.07 
 
 
299 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  42.09 
 
 
312 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  38.69 
 
 
302 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  36.82 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  35.38 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  40.37 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  39.64 
 
 
290 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  39.64 
 
 
290 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  39.56 
 
 
290 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  38.35 
 
 
287 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  35.45 
 
 
289 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.32 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.99 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.28 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.25 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.62 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  25.85 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  28.42 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.63 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  27.76 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  28.06 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.62 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.15 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27.8 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27.8 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.04 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27.8 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  28.98 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.66 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  30.77 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.54 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.7 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  26.55 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.04 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.35 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  29.2 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.8 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  22.61 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.52 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.61 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  25.27 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.61 
 
 
311 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  26.18 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  29.36 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  28.68 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  23.11 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  21.8 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.77 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.59 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  20.97 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  26.78 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  20.36 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  23.44 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25.55 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.55 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  24.71 
 
 
340 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.43 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.31 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.31 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  23.47 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  27.9 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 
652 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.87 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  21.31 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.03 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  28.52 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  29.63 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>