144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2947 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  64.34 
 
 
318 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  61.81 
 
 
312 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  62.82 
 
 
312 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  60.27 
 
 
310 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  61.21 
 
 
313 aa  345  7e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  60.29 
 
 
312 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  61.51 
 
 
313 aa  334  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  52.86 
 
 
303 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  52.31 
 
 
304 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  51.96 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  50.35 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  51.27 
 
 
308 aa  271  8.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  50.92 
 
 
310 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  50.37 
 
 
306 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  49.47 
 
 
306 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  53.98 
 
 
303 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  51.11 
 
 
304 aa  262  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  49.12 
 
 
306 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  46.69 
 
 
320 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  53.85 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  52.96 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  51.39 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  45.94 
 
 
301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  41.33 
 
 
303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  44.85 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  44.97 
 
 
320 aa  208  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  42.86 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  38.69 
 
 
295 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  36.9 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  36.03 
 
 
300 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  40.29 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  40.29 
 
 
290 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  39.56 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  38.1 
 
 
356 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.69 
 
 
287 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  39.77 
 
 
289 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.59 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.19 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  29.06 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.69 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.35 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.87 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.8 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.31 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.92 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.92 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.92 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.02 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.77 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  26.56 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.78 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  19.86 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  28.14 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  31.42 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  24.68 
 
 
288 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.58 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  27.66 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.91 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.46 
 
 
302 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  34.71 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  25.87 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.37 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  23.79 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  27.19 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  23.77 
 
 
290 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 
350 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.55 
 
 
304 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  32.81 
 
 
429 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  26.64 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.59 
 
 
310 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.19 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  25.55 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  23.57 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  20.89 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.33 
 
 
292 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  30.08 
 
 
448 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  27.14 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.03 
 
 
292 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  28.05 
 
 
428 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  21.66 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  25.31 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.5 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  26.43 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  20.07 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  35.05 
 
 
575 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  21.03 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  27.31 
 
 
311 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  28.92 
 
 
323 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  23.19 
 
 
312 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 
322 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.96 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>