295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  616  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  80.46 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  70.75 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  62.79 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  62.79 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  62.79 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  60.19 
 
 		 312 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  61.69 
 
 		 316 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  63.88 
 
 		 317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  64.04 
 
 		 302 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  57.1 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  54.08 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  58.12 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  56.11 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  52.54 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  51.35 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  53.4 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  55.92 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  54.05 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  50.84 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  48.15 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  52.56 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  48.69 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  51.33 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  42.32 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  42.05 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  42.61 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  40.91 
 
 		 363 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  44.68 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  37.77 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  34.19 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  37.76 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  40.71 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.93 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  36.22 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  31.23 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.37 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.45 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.62 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.68 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.62 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.24 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.35 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.21 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.21 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.62 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.87 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25.96 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.16 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.57 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  32.21 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.51 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.67 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.95 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.4 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  27.46 
 
 		 293 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.23 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.77 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.66 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  27.43 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.64 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  31.03 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  26.27 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  25.36 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.44 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.38 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  27.43 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.15 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  29.8 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.49 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  24.9 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.47 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  31.23 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  31.05 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  32.17 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  31.33 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.94 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  34.95 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  30.67 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  32.9 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  28.07 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  31.74 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  31.74 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  27.92 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  28.25 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  24.71 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  27.92 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.7 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>