179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2793 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  98.69 
 
 
306 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  80.26 
 
 
306 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  74.43 
 
 
320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  59.52 
 
 
301 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  59.93 
 
 
308 aa  362  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  59.06 
 
 
309 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  60.27 
 
 
310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  48.77 
 
 
303 aa  294  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  49.29 
 
 
324 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  46.32 
 
 
312 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  43.9 
 
 
310 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  44.76 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  45.99 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  45.22 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  44.12 
 
 
318 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  44.85 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  46.97 
 
 
304 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  46.59 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  44.8 
 
 
304 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  47.69 
 
 
303 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  44.74 
 
 
318 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  46.74 
 
 
303 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  47.17 
 
 
303 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  44.59 
 
 
312 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  41.02 
 
 
320 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  43.43 
 
 
299 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  41.67 
 
 
312 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  38.57 
 
 
295 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  41.13 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  37.05 
 
 
300 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  37.5 
 
 
302 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  40.79 
 
 
290 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  38.63 
 
 
290 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  38.63 
 
 
290 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  33.58 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  41.58 
 
 
287 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.97 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.62 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  26.72 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.02 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  25.49 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  22.64 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.24 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.93 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25.52 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.14 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.63 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  22.06 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.27 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.78 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.78 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.29 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.77 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  23.51 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  31.85 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  28.77 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  30.7 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.79 
 
 
287 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  23.93 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  26.01 
 
 
323 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.91 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.59 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  24.9 
 
 
322 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.12 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.02 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  25.47 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  27.23 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.08 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  27.03 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  25.51 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  26.98 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.34 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25.94 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.94 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.02 
 
 
328 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.89 
 
 
288 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.38 
 
 
444 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 
350 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  23.88 
 
 
302 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  23.88 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  23.88 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.71 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.09 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  23.99 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  25.1 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25.62 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  23.21 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.54 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.07 
 
 
353 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  30.36 
 
 
286 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>