278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0868 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  100 
 
 
322 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  53.11 
 
 
303 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  55.48 
 
 
304 aa  348  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  50 
 
 
309 aa  302  5.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  50.52 
 
 
298 aa  301  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  46.44 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  41.97 
 
 
310 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  38.91 
 
 
303 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  35.76 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  36.68 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  34.92 
 
 
300 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  35.08 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 
302 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  36.3 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  30.87 
 
 
302 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  28.08 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  32.97 
 
 
306 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.92 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.65 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.99 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.91 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.24 
 
 
287 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.55 
 
 
293 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  27.94 
 
 
303 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  26.52 
 
 
292 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  25.6 
 
 
298 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  28.07 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.68 
 
 
294 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  28.67 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.82 
 
 
290 aa  96.3  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.78 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.91 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.75 
 
 
295 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  31.09 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  24.49 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.81 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.27 
 
 
297 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.12 
 
 
310 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  26.25 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.4 
 
 
302 aa  86.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  28.92 
 
 
298 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.1 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.91 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  24.36 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.14 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.51 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  23.48 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  25.83 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  31.98 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.31 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  26.12 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.7 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  31.21 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  27.62 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  26.81 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  25.78 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  26.15 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  25.83 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.42 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.42 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  26.26 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.42 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  30.34 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  23.55 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  27.97 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  24.88 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.83 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.28 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.1 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  25.23 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.13 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  26.5 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.82 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.53 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  25.3 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  24.91 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  25.49 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.69 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  28.22 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  27.83 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  28.11 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.17 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  26.98 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  27.39 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.2 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>