More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1580 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  593  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  58.13 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  54.67 
 
 		 287 aa  334  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  51.56 
 
 		 287 aa  329  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  52.07 
 
 		 288 aa  329  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  51.21 
 
 		 287 aa  325  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  47.93 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  46.37 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  44.56 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  41.03 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  41.38 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  42.6 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  42.36 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  42.59 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  40.85 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  39.56 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  42.61 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  38.57 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  40.45 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  39.16 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  39.52 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  39.79 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  35.21 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  36.49 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  39.43 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  40.14 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  36.33 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.68 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  36.11 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  36.5 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  37.64 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  36.4 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  36.17 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  33.94 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  32.39 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  32.04 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  32.28 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  31.93 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.59 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  30.48 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  35.04 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.23 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  35.04 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  31.23 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  33.08 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  32.86 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  32.19 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  31.85 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  31.37 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  34.55 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.53 
 
 		 314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  30.88 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.62 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  34.29 
 
 		 393 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.53 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  29.21 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  32.61 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  31.12 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  31.12 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  31.12 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.03 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  29.64 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  31.45 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.21 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  29.93 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  31.71 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  30.66 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  33.09 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  31.05 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  30.12 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  33.06 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.22 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  30.42 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  30.03 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.86 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.86 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.77 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  29.58 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.04 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  31.95 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.48 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  27.79 
 
 		 418 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  32.23 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  29.35 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.99 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.8 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  34.23 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  30.98 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  31.44 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  30.4 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  31.08 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  28.38 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  30.47 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.93 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  35.47 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  36.63 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>