88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1880 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 652 aa  1276    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  36.39 
 
 		 684 aa  324  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  34.92 
 
 		 638 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  37.68 
 
 		 638 aa  320  5e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  38.07 
 
 		 641 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  45.63 
 
 		 448 aa  301  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  43.63 
 
 		 528 aa  299  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  41.09 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  41.88 
 
 		 469 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  33.7 
 
 		 505 aa  228  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  42.77 
 
 		 828 aa  223  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  36.24 
 
 		 445 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  35.44 
 
 		 436 aa  203  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 		 530 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  37.04 
 
 		 546 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  34.03 
 
 		 419 aa  178  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  36.05 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  32.71 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  33.09 
 
 		 419 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 391 aa  72  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  29.72 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  24.28 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  27.86 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  24.72 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  25.68 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  29.71 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  26.17 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  27.62 
 
 		 405 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  28.51 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  28.51 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  27.25 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  29.91 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  28.04 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  28.04 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  27.78 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  23.82 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  27.73 
 
 		 408 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  29.32 
 
 		 415 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  27.14 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.73 
 
 		 458 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  30.34 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 		 434 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.87 
 
 		 446 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  22.11 
 
 		 320 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 		 296 aa  51.6  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  27.49 
 
 		 313 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  24.89 
 
 		 331 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  24.52 
 
 		 429 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  26.18 
 
 		 432 aa  50.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  21.02 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  24.17 
 
 		 331 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  24.54 
 
 		 432 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 		 309 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  25.39 
 
 		 467 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  26.48 
 
 		 443 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  24.49 
 
 		 330 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  24.48 
 
 		 398 aa  47.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  34.34 
 
 		 318 aa  47.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  25.16 
 
 		 459 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  33 
 
 		 295 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.32 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  41.07 
 
 		 288 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.2 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.48 
 
 		 310 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  32.63 
 
 		 312 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.13 
 
 		 298 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  25.83 
 
 		 466 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.21 
 
 		 290 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  25.96 
 
 		 428 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  27.74 
 
 		 310 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.93 
 
 		 302 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  23.42 
 
 		 428 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  31.4 
 
 		 385 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1580 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 		 292 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  27.91 
 
 		 421 aa  43.9  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 		 303 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  29.05 
 
 		 391 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  25.76 
 
 		 312 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  37.23 
 
 		 309 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.07 
 
 		 291 aa  43.9  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.17 
 
 		 287 aa  43.9  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  43.9  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 		 436 aa  43.9  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>