196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0846 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  84.15 
 
 
466 aa  751    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  892    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  48.44 
 
 
429 aa  359  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  49.66 
 
 
415 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  46.65 
 
 
459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  36.7 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  33.13 
 
 
450 aa  159  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  35.79 
 
 
434 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  31.24 
 
 
446 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  33.96 
 
 
520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  31.55 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  30.95 
 
 
405 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  32.67 
 
 
423 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  32.67 
 
 
408 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  32.67 
 
 
408 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  32.33 
 
 
408 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 
435 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  20.57 
 
 
431 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  29.34 
 
 
449 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 
391 aa  90.5  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 
430 aa  84  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  38.81 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  29.63 
 
 
641 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.6 
 
 
458 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  28.46 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  29.05 
 
 
684 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.53 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  30.24 
 
 
442 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
528 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.15 
 
 
296 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  29.03 
 
 
426 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.58 
 
 
436 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 
298 aa  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.27 
 
 
443 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.9 
 
 
447 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  29.1 
 
 
638 aa  63.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  33.75 
 
 
340 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  29.48 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.07 
 
 
419 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.35 
 
 
295 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.7 
 
 
287 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.27 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  29.1 
 
 
308 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  24.89 
 
 
451 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.75 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.8 
 
 
297 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  31.01 
 
 
303 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.44 
 
 
312 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.38 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.98 
 
 
288 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  24.46 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  33.09 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  29.69 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  29.26 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.97 
 
 
312 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.53 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  26.06 
 
 
308 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25 
 
 
292 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.39 
 
 
314 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.08 
 
 
319 aa  57.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  38.02 
 
 
366 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.72 
 
 
287 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.03 
 
 
308 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 
295 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  30.34 
 
 
436 aa  56.6  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.39 
 
 
314 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.53 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.45 
 
 
328 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  27.46 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.81 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  26.05 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  20.22 
 
 
446 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  30.16 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  24.31 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.01 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.79 
 
 
324 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.39 
 
 
318 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  21.59 
 
 
345 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.97 
 
 
295 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.43 
 
 
317 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  34.62 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.94 
 
 
314 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  26.79 
 
 
320 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  24.71 
 
 
286 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  24.77 
 
 
317 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  24.6 
 
 
309 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  24.77 
 
 
317 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.35 
 
 
302 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  34.27 
 
 
311 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  24.77 
 
 
317 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  24.77 
 
 
317 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  31.11 
 
 
314 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  33.82 
 
 
350 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.87 
 
 
290 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.58 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  23.23 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>