250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3160 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  893    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  78.8 
 
 
426 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  55.1 
 
 
419 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  52.49 
 
 
428 aa  418  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  37.53 
 
 
426 aa  285  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  33.04 
 
 
451 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  30.44 
 
 
412 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
398 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
381 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  27.4 
 
 
398 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  26.8 
 
 
391 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  33.83 
 
 
392 aa  99.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.86 
 
 
384 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  28.36 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  25.5 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  29.13 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.72 
 
 
401 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.39 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.49 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  29.47 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.91 
 
 
404 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  39.82 
 
 
424 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  30.3 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  30.45 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  25.81 
 
 
564 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  23.12 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  23.41 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  28.46 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  23.12 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  24.8 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  22.83 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  26.74 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  22.83 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  31.22 
 
 
491 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  23.77 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  36.3 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  22.83 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  38.66 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  22.77 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  24.79 
 
 
389 aa  77  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  26.61 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  28.46 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  30.87 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  29.66 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  36.67 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  29.96 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.07 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21.99 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  31.3 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  34.55 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  28.95 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  21.33 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  29.87 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  31.78 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.1 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  32.07 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  28.81 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  33.14 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  29.95 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  23.05 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  35.9 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  35.85 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.05 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.83 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  29.25 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  28.35 
 
 
380 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.57 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  27.72 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  35.2 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  28.85 
 
 
466 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  37.12 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  25.55 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  27.86 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  31.18 
 
 
395 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  33.33 
 
 
452 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  27.22 
 
 
412 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.12 
 
 
448 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  26.03 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  30.46 
 
 
575 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  23.28 
 
 
410 aa  63.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  31.86 
 
 
317 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.66 
 
 
458 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  23.38 
 
 
446 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  24.93 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  23.84 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  28.12 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  25.11 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  34.65 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 
385 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  29.41 
 
 
427 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  23.96 
 
 
294 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  60.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.27 
 
 
303 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>