75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1282 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 430 aa  845    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  37.53 
 
 		 435 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  37.86 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  33.25 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  34.04 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  26.5 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  23.82 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  26.17 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  24.43 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  27.33 
 
 		 450 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  25.89 
 
 		 466 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  25.35 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  30.31 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  25.79 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  26.32 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  25.34 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  25.34 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  25.32 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  25.72 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  23.43 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.51 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.09 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  31.55 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  27.36 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  25.26 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.47 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  29.74 
 
 		 641 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  30.21 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  28.25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  26.27 
 
 		 638 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  25.82 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.54 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  26.73 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.11 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.25 
 
 		 297 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  23.46 
 
 		 638 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  26.2 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  28.26 
 
 		 299 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.2 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  31.72 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  29.79 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  29.85 
 
 		 304 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  22.82 
 
 		 309 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  25.91 
 
 		 684 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.88 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  29.85 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.23 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  30.61 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  25.81 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  26.09 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  31.45 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.23 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.35 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.21 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  25.69 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.84 
 
 		 287 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  19.12 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.83 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.52 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.96 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  30.6 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  28.89 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.52 
 
 		 287 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 		 575 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>