More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3321 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  876    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  68.62 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  69.07 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  64.57 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  64.56 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  67.79 
 
 		 444 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  65.23 
 
 		 447 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  45.12 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  46.31 
 
 		 432 aa  315  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  31.84 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.4 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  31.58 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.41 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.76 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.68 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.39 
 
 		 428 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  32.87 
 
 		 469 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  30.54 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.83 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  32.05 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  33.23 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  32.46 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  28.68 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  31.45 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  30.88 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  31.44 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  31.63 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  30.13 
 
 		 436 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  30.79 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  29.26 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.02 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  29.15 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  29.16 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  30.65 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.94 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  28.76 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  29.86 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  31.64 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.52 
 
 		 296 aa  92.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  35.47 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  31.13 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 		 297 aa  86.7  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.96 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  31.87 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.42 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.25 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.14 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.14 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.39 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.27 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.81 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.71 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.97 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  31.15 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.23 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.98 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  29.36 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  28.18 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  28.18 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  25.68 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  33.15 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.49 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.35 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  27.49 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  28.19 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.22 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.27 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.06 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  30.98 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  26.89 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  23.14 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  32.8 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.63 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  22.62 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.67 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  24.58 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.59 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.11 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.54 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  32.31 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  23.88 
 
 		 304 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  28.26 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.65 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  27.33 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>