More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2501 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  831    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  70.57 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  65.82 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  58.24 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  61.92 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  55.3 
 
 		 454 aa  385  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  56.07 
 
 		 449 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  56.07 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  56.07 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  50.6 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  53.33 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  57.58 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  52.66 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  56.99 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  58.87 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  53.29 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  56.01 
 
 		 457 aa  348  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  55.24 
 
 		 430 aa  348  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  54.48 
 
 		 412 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  52.53 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  55.04 
 
 		 444 aa  316  6e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  48.33 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  49.62 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  50.12 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  27.4 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.11 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  32.09 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.58 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.52 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  33.68 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  31.07 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.79 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.37 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  34.37 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.2 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.86 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.39 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.66 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.47 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.71 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  30.47 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  22.52 
 
 		 448 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  32.37 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.15 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  28.05 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  37.4 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  30.87 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  30 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.19 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.41 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.26 
 
 		 302 aa  93.2  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.06 
 
 		 296 aa  86.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  33.47 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.75 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.59 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  39.83 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  31.84 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  34.76 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.18 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.23 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.65 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  32.06 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.29 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.83 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  31.88 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  41.58 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  31.3 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.17 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  37.1 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.96 
 
 		 296 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  30.33 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.64 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  30.47 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  36.43 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  29.58 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  37.62 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.27 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  26.11 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.25 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  34.95 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  30.96 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  37.14 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  38.39 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.38 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.65 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  51.67 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  35.09 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  31.97 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.29 
 
 		 310 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  48.33 
 
 		 331 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  29.08 
 
 		 286 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.63 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  32.71 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  34.01 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>