283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4966 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
450 aa  915    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  51.45 
 
 
448 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  47.78 
 
 
443 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  50.23 
 
 
428 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  47.1 
 
 
444 aa  425  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  48.11 
 
 
446 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  32.94 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.88 
 
 
440 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  34.51 
 
 
440 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.98 
 
 
444 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.48 
 
 
458 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.62 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.46 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.2 
 
 
443 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.75 
 
 
429 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.39 
 
 
447 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  28.09 
 
 
436 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
436 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  27.68 
 
 
443 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  28.39 
 
 
469 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.72 
 
 
444 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  29.43 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  25.88 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  25.4 
 
 
436 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  26.33 
 
 
437 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  26.54 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  26.36 
 
 
436 aa  118  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 
430 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  26.32 
 
 
430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  25.37 
 
 
428 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  24.94 
 
 
455 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  28.3 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  24.51 
 
 
429 aa  110  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  25.15 
 
 
440 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  24.64 
 
 
454 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 
430 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  26.55 
 
 
430 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  27.19 
 
 
430 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  26.59 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  24.7 
 
 
433 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 
430 aa  96.3  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  24.7 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  25.14 
 
 
449 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  25.14 
 
 
444 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  25.07 
 
 
449 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  25.07 
 
 
449 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  24.7 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.1 
 
 
290 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  24.13 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  32.4 
 
 
575 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.6 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.56 
 
 
296 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  23.41 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  25.94 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  22.9 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  26.28 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  28.02 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  24.55 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.07 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  23.62 
 
 
412 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  22.81 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.88 
 
 
288 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 
310 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  22.68 
 
 
404 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.12 
 
 
287 aa  63.9  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  23.59 
 
 
552 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.1 
 
 
291 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  23.38 
 
 
415 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.87 
 
 
328 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.45 
 
 
287 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  29.61 
 
 
358 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  26.69 
 
 
303 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  22.68 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  32.52 
 
 
310 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.38 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.42 
 
 
314 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  32.35 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.32 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  27.16 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  22.68 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26.42 
 
 
564 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  32.35 
 
 
317 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  32.35 
 
 
317 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.35 
 
 
317 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  29.1 
 
 
297 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  22.42 
 
 
404 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  28.3 
 
 
479 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  23.57 
 
 
296 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  28.51 
 
 
384 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>