206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0817 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
552 aa  1125    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  30.46 
 
 
412 aa  97.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.1 
 
 
479 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  27.3 
 
 
564 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  24.9 
 
 
380 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.39 
 
 
418 aa  87  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.67 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  22.5 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  31.82 
 
 
405 aa  76.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.9 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.57 
 
 
431 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  33.11 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  28.8 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  26.39 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  28.88 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  26.85 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  26.49 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  24.02 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  31.25 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  27.43 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  22.93 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  24.78 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  29.2 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  20.34 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  23.12 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.96 
 
 
395 aa  67  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  30.41 
 
 
421 aa  67  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  29.41 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.61 
 
 
463 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  28.04 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  29.52 
 
 
387 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.76 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  22.88 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  26.41 
 
 
442 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  23.05 
 
 
404 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  36.67 
 
 
394 aa  64.7  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  36.13 
 
 
411 aa  64.3  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
325 aa  64.3  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  23.05 
 
 
404 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  23.43 
 
 
450 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  34.88 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  31.16 
 
 
407 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 
422 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  22.73 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.57 
 
 
444 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  26.05 
 
 
349 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  22.55 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  29.8 
 
 
443 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  27.81 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  30.53 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  22.73 
 
 
362 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  23.53 
 
 
326 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  28.21 
 
 
384 aa  62  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  31.3 
 
 
370 aa  61.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  27.38 
 
 
436 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  22.73 
 
 
404 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21.82 
 
 
402 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 
402 aa  60.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.62 
 
 
444 aa  60.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.52 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  27.56 
 
 
382 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  22.15 
 
 
405 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  27.78 
 
 
422 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.81 
 
 
440 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  32 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  33.08 
 
 
375 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.73 
 
 
404 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.87 
 
 
444 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
497 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  26.42 
 
 
440 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  27.78 
 
 
432 aa  57.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.61 
 
 
419 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  28.06 
 
 
393 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.38 
 
 
447 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.98 
 
 
458 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  33.03 
 
 
333 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.98 
 
 
391 aa  57.4  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25.37 
 
 
443 aa  57  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  22.4 
 
 
404 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  34.74 
 
 
314 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  29.21 
 
 
399 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  24.63 
 
 
319 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  24.63 
 
 
319 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  29.29 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  23.1 
 
 
316 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  33.06 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  28.88 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  29.69 
 
 
463 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  22.18 
 
 
401 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  25.87 
 
 
441 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.4 
 
 
473 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  23.21 
 
 
417 aa  54.7  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  25.79 
 
 
380 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  28.77 
 
 
439 aa  54.3  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  25.56 
 
 
384 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.71 
 
 
444 aa  53.9  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>