288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4822 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 430 aa  826    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  66.03 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  54.88 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  54.09 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  52.17 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  57.14 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  51.14 
 
 		 454 aa  353  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  46.65 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  55.68 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  52.78 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  48.95 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  52.78 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  56.38 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  52.78 
 
 		 449 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  51.03 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  53.47 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  51.25 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  56.18 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  48.96 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  49.52 
 
 		 432 aa  325  9e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  51.96 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  49.42 
 
 		 431 aa  322  8e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  48.58 
 
 		 457 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  46.51 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  32.2 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.8 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  26.1 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.49 
 
 		 436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  30.82 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  33.43 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.5 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.61 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.98 
 
 		 444 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  24.82 
 
 		 436 aa  133  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.23 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.06 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  33.24 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.09 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.19 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  31.6 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.85 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.7 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  28.8 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.35 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.93 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.94 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.23 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.97 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.57 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  31.79 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.51 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.89 
 
 		 290 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  30.08 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  33.84 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.16 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.5 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.21 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  35.54 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  32.85 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.47 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.36 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.69 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  42.86 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  33.86 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.65 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  45 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  32.34 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  33.14 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  28.76 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  38.54 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.54 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  28.23 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  32.99 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  35.92 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  31.74 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.66 
 
 		 317 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.49 
 
 		 287 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  50 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  34.51 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  48.39 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  34.71 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.35 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.93 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  32.32 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  46.88 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  41.77 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.15 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.44 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  31.06 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  21.53 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.89 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>