279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0188 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  821    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  30.48 
 
 
442 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 
426 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  30.15 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 
428 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  27.29 
 
 
419 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  31.44 
 
 
423 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  31.38 
 
 
552 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  29.6 
 
 
418 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  27.79 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  32.18 
 
 
392 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  29.36 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.11 
 
 
380 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.49 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
384 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.59 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
384 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 
451 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 
398 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  27.61 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  28.24 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  32.95 
 
 
463 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  25.41 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.48 
 
 
432 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  30.04 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  29.44 
 
 
564 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  34.45 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.7 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.68 
 
 
443 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.49 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  29.28 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  32.42 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  26.67 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 
429 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  28.62 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.48 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  25.48 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  28.25 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  26.8 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  29.5 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  26.45 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  23.66 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.44 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  30.72 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  34.51 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.5 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  31.31 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  27.13 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.85 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.2 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.09 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  30.61 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  24.56 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  29.87 
 
 
575 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  30.97 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  29.02 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.57 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  25.58 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.54 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.57 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  24.68 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  28.07 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.22 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.39 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.63 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  33.54 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.7 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  38.33 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  28.35 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  29.68 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  23.59 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  25.77 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  30.68 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  25.2 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  31.74 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  27.88 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  32.05 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  27.64 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.48 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  33.74 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  29.35 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  26.37 
 
 
316 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  30.2 
 
 
299 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.32 
 
 
323 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
444 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  22.94 
 
 
308 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  24.63 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  22.63 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.14 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  23.66 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  24.69 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  25.57 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  23.44 
 
 
360 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.51 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  25.32 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  26.23 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  33.82 
 
 
290 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>