280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2130 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
297 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  59.65 
 
 
358 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  41.79 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  41.79 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  41.79 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  38.61 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  36.71 
 
 
321 aa  165  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  35.91 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  36.64 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  39.57 
 
 
286 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  34.68 
 
 
286 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  36.21 
 
 
298 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.69 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.58 
 
 
340 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.26 
 
 
290 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 
340 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.17 
 
 
292 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.9 
 
 
295 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.6 
 
 
329 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.37 
 
 
288 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.65 
 
 
353 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.75 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  37.58 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.72 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.84 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.36 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.71 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.16 
 
 
363 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.15 
 
 
287 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.9 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  38.27 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  30.2 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.69 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.27 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.86 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.82 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.86 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.53 
 
 
328 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  29.86 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.17 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  27.75 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.18 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.44 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.95 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  26.74 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  33.17 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.43 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.64 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.14 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  34.06 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  29.73 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  30.09 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  23.55 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  29.52 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  31.13 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.51 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.35 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  30 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.44 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  30 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.21 
 
 
440 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  32.09 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.09 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  30.08 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.46 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  36.62 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  35.71 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  29.81 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  29.09 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  29.09 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  30.39 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  29.09 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.73 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  27.78 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.75 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  31.9 
 
 
458 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.8 
 
 
443 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  28.86 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.37 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  30.73 
 
 
444 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.52 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  35.29 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  34.45 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  29.47 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  28.37 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  24.54 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  25.78 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.44 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  29.65 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  26.13 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.24 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  35.44 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.7 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.58 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  37.17 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>