More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2508 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  872    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  85 
 
 
440 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  57.05 
 
 
436 aa  517  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  53.76 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  34.03 
 
 
450 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  35.35 
 
 
436 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  31.96 
 
 
428 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  31.98 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  30.91 
 
 
444 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  27.92 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 
448 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  30.99 
 
 
446 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  33.18 
 
 
469 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  32.29 
 
 
444 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  31.47 
 
 
447 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  32.21 
 
 
443 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 
432 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.05 
 
 
443 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  32.95 
 
 
436 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  30.38 
 
 
429 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  35.28 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  29.46 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  31.06 
 
 
428 aa  170  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  33.86 
 
 
429 aa  167  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  31 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  30.22 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  31.25 
 
 
444 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  30.75 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 
434 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  31.58 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  31.2 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  31.73 
 
 
431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  31.84 
 
 
432 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  30.65 
 
 
449 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  30.65 
 
 
449 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  30.65 
 
 
449 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  26.85 
 
 
440 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  28.28 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  29.37 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  31.97 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  29.02 
 
 
437 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  29.22 
 
 
430 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  27.71 
 
 
430 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.18 
 
 
473 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  27.84 
 
 
430 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  29.7 
 
 
441 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.89 
 
 
294 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  24.62 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.8 
 
 
296 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 
294 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  30.66 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.92 
 
 
295 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.57 
 
 
291 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  29.94 
 
 
444 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.05 
 
 
295 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  28.23 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 
391 aa  87.8  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.67 
 
 
296 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
296 aa  87.4  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 
297 aa  86.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.56 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  31 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.85 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  24.77 
 
 
331 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  24.77 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  24.77 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.23 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.06 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.28 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  30.14 
 
 
289 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  30.14 
 
 
289 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  30.14 
 
 
289 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  31.15 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.84 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  29.95 
 
 
286 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.22 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.88 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  25.53 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.07 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  26.52 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.74 
 
 
295 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  28.26 
 
 
358 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.21 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  26.73 
 
 
297 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  26.52 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.44 
 
 
314 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.14 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  24.64 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.88 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.64 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.13 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  25.63 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  29.95 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>