More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3127 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
444 aa  874    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  47.28 
 
 
428 aa  283  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  38.94 
 
 
436 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  38.48 
 
 
429 aa  260  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  30.23 
 
 
436 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.83 
 
 
440 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  35.65 
 
 
436 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  35.28 
 
 
440 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  33.52 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  35.87 
 
 
432 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  36.2 
 
 
436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.06 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  26.48 
 
 
428 aa  163  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25.12 
 
 
443 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  28.83 
 
 
436 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.17 
 
 
444 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 
448 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  36.76 
 
 
434 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 
446 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.51 
 
 
429 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.59 
 
 
458 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  35.46 
 
 
430 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  35.07 
 
 
430 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.84 
 
 
450 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  29.72 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  32.32 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  33.24 
 
 
412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  32.81 
 
 
454 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.83 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  31.83 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  32.83 
 
 
440 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  30.39 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  31.55 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  33.43 
 
 
437 aa  133  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  37.62 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  35.2 
 
 
430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  34.38 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  32.75 
 
 
430 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  34.65 
 
 
432 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  33.24 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  31.99 
 
 
473 aa  120  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  31.78 
 
 
455 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  32.25 
 
 
444 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  31.04 
 
 
449 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  32.3 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  32.52 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  30.6 
 
 
449 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  30.6 
 
 
449 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  29.79 
 
 
430 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 
444 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  32.21 
 
 
457 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.21 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  31.56 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  32.28 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.41 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  37.65 
 
 
575 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.07 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.41 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30.45 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.04 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.16 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  31.82 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  31.1 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  30.49 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.16 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  26.5 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.84 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  29.28 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  32.67 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  32.56 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  32.97 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.45 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  32.97 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  32.97 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  34.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.77 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.35 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.2 
 
 
288 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  20.43 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  31.07 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  30.42 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.49 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.96 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.85 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.85 
 
 
294 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  27.34 
 
 
304 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.7 
 
 
316 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  32.31 
 
 
310 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  28.85 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.24 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  31.48 
 
 
312 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.86 
 
 
309 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>