136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5109 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1088    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  62.44 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  45.75 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  45.89 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  45.61 
 
 		 415 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  44.74 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  37.83 
 
 		 432 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  45.15 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  44.2 
 
 		 422 aa  253  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  47 
 
 		 405 aa  250  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  36.56 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  38.82 
 
 		 424 aa  212  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  38.26 
 
 		 429 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  38.55 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  37.53 
 
 		 413 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  36.94 
 
 		 392 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  33.68 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  34.65 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  33.45 
 
 		 491 aa  124  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  31.53 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  30.02 
 
 		 422 aa  101  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  34.01 
 
 		 561 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  33.55 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  31.27 
 
 		 421 aa  94.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  28.62 
 
 		 384 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  33.91 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  32.65 
 
 		 384 aa  90.5  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  33.74 
 
 		 387 aa  90.5  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.12 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.27 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  27.22 
 
 		 552 aa  87  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  25.13 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  31.15 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  29.89 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  30.04 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  28.95 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  29.6 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  29.25 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  29.25 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  33.54 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.08 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  32.42 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.06 
 
 		 391 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  31.25 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  26.09 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  35.75 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  29.38 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  34.01 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 		 431 aa  70.1  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  31.32 
 
 		 382 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  29.2 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  26.64 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  29.97 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  28.38 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  28.22 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.48 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  27.89 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  26 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  30.37 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.82 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3213  protein of unknown function DUF58  31.43 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0779405  normal  0.18342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  30.38 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  29.41 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  33.13 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  29.32 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.39 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.03 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  32.39 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0682  hypothetical protein  28.4 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0197418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  30.08 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  29.2 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.8 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  26.22 
 
 		 451 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  24.69 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.98 
 
 		 469 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 		 402 aa  54.7  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  26.5 
 
 		 380 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 		 444 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  20.86 
 
 		 398 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  30.3 
 
 		 339 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  25.49 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  25.14 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 		 394 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 		 505 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 		 358 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  26.56 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  21.67 
 
 		 436 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  31.67 
 
 		 391 aa  50.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  29.61 
 
 		 448 aa  50.4  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>