More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3799 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  65.26 
 
 		 312 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  57.28 
 
 		 341 aa  325  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  55.67 
 
 		 335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  46.38 
 
 		 316 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  46 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  44.69 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  45.03 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  35.78 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3219  protein of unknown function DUF58  39.1 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000742031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  36.68 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  34.43 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  34.54 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  32.67 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  32.34 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  36.68 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  32.33 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  37.41 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  33.55 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  31.58 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  32.01 
 
 		 317 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  35.45 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  37.74 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  39.27 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  31.82 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.84 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  31.94 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  30.92 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.98 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  32.98 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  36.4 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  31.21 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  37 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  28.95 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  32.66 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  32.05 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  28.26 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  29.2 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  31.84 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.39 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  29.39 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  27.96 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  27.96 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  29.53 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  28.99 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  28.95 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  31.85 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  29.2 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  31.1 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  27.63 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  33.87 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  29.84 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  29.84 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  29.84 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  34.15 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.41 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  30.04 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.48 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  34.21 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.48 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.63 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.29 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  31.22 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.52 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  33 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.14 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  30.58 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.05 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30.1 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.01 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.29 
 
 		 309 aa  99.8  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  28.02 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  30.58 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  31.07 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  30.86 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.61 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  31.22 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  32.71 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  29.91 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.9 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  39.2 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.3 
 
 		 291 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.09 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  36.19 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  28.22 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  47.32 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  30.19 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.77 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.64 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  39.04 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.5 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>