88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2871 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 446 aa  838    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  50.73 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  43 
 
 		 435 aa  266  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  43.9 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  32.59 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  38.65 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  30.63 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  31.09 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  30.68 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  32.4 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  35.48 
 
 		 415 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  28.6 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  31.21 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  34.53 
 
 		 520 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  34.92 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  31.58 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  28.85 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  34.81 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  34.07 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  34.81 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  30.71 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  29 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  28.89 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  32.95 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  28.64 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.56 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  30.85 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  27.4 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.44 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  31.01 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  27.25 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.72 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  32.08 
 
 		 638 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.12 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  26.17 
 
 		 308 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.21 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  31.86 
 
 		 638 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.31 
 
 		 331 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  25.31 
 
 		 505 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.73 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  40 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  30.68 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.85 
 
 		 331 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  31.32 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.22 
 
 		 296 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  37.14 
 
 		 319 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.69 
 
 		 340 aa  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.13 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  21.67 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.34 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.39 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  28.46 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  24.53 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  27.71 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  41.79 
 
 		 331 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.77 
 
 		 290 aa  47  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  32.4 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  37.31 
 
 		 328 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.15 
 
 		 309 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.46 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25.52 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 		 296 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.22 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  32.22 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  23.27 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  21.62 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  25.27 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  32.69 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  34.72 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.49 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  26.25 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.53 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  36.11 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.1 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  23.39 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  28.95 
 
 		 291 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  25.89 
 
 		 828 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  27.17 
 
 		 304 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  23.33 
 
 		 293 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>