196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0586 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  761    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  40.56 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  40.06 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  31.32 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  31.27 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  27.67 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  30.64 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  27.4 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  21.47 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  24.04 
 
 		 380 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.46 
 
 		 442 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  21.15 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.67 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  30.26 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  33.18 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  32.75 
 
 		 419 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  21.83 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  21.97 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  21.59 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  21.88 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  22.84 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  24.17 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  28.35 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  21.66 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  21.59 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  23 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.24 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  23.9 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.69 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  30.59 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  20.97 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  32.6 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  31.7 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  32.35 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  30.45 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  29.55 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  29.03 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  29.86 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.3 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  22.94 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  29.96 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.69 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  26.97 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  28.95 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  29.56 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  29.89 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  26.21 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  28.99 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  33.15 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  19.44 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  28 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  26.23 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  28.31 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  27.4 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  28.35 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  29.09 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  26.54 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  29.09 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  17.7 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  33.85 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  29.09 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  27.15 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  33.59 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  27.27 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  30.57 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  26.05 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  27.82 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  27.46 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.18 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  30.53 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.37 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  25.36 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  23.6 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 		 487 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  34.19 
 
 		 444 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  25.96 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  27.7 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  25.23 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  32.65 
 
 		 445 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.19 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 439 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  27.1 
 
 		 641 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.09 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  28.57 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  28.31 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  20.8 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  25.28 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.44 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  24.19 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.48 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>