208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3803 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  37.09 
 
 		 497 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  34.66 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  37.24 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  35.13 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  36.06 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  37.42 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.41 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  30.97 
 
 		 564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  31.23 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  35.83 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  37.45 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  34.67 
 
 		 453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  31.95 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  31.5 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  30.24 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  30.74 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  35.06 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.09 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  32.68 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  34.26 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.56 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  30.45 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  34.65 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  32.01 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  32.16 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  27.63 
 
 		 479 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  34.24 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  35.29 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  34.31 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  34.31 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  33.01 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  33.74 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  30.11 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  31.39 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  37.58 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  29.13 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  31.63 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  29.75 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  32.51 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  33.15 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.87 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  27.66 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.41 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  33.55 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  34.34 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  25.41 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.74 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  34.81 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  33.59 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.03 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  32.47 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  31.27 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  20.75 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  32.37 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  28.67 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  34.07 
 
 		 430 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  29.8 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.17 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  23 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.98 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  26.25 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  25.51 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  34.07 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.16 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  30.23 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  32.03 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  24.43 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  44.62 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  44.62 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  44.62 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  20.13 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  35.11 
 
 		 433 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  33.59 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 		 505 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  41.54 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.69 
 
 		 294 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  43.08 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  34.31 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  34.43 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  27.46 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  31.67 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  26.44 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  40 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  26.27 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  36.3 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  21.51 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  34.38 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  19.18 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>