120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2043 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  58.8 
 
 
276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  40.62 
 
 
257 aa  185  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  38.41 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  38.41 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  34.7 
 
 
294 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  37.84 
 
 
263 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  31.73 
 
 
293 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  29.2 
 
 
349 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  27.07 
 
 
321 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  30.22 
 
 
344 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  28.67 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  28.68 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  27.94 
 
 
462 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.44 
 
 
338 aa  89.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  29.75 
 
 
346 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  28.37 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  30.22 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  29.18 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.67 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  29.12 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  29.41 
 
 
323 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  24.25 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.44 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  30.56 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  29.56 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  27.54 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  27.54 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.8 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  27.17 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  26.2 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  24.91 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  29.2 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  31.4 
 
 
417 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  28.94 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  29.35 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  32.42 
 
 
316 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  28.03 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  25.09 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  25.09 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  25.09 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  24.63 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  25.79 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  25.09 
 
 
365 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  25.09 
 
 
365 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.04 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.24 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  24.91 
 
 
355 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  24.91 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  28.21 
 
 
318 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  25.56 
 
 
337 aa  62  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  22.35 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  26.75 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  26.75 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  25.98 
 
 
399 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  22.86 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  26.49 
 
 
391 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  26.32 
 
 
943 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  24.11 
 
 
344 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  26.74 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  24.37 
 
 
337 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  25.37 
 
 
360 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  26.49 
 
 
387 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  21.96 
 
 
552 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  22.83 
 
 
374 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  29.35 
 
 
431 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  26.29 
 
 
402 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  29.73 
 
 
431 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  27.55 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  26.89 
 
 
380 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  26.13 
 
 
443 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  25.48 
 
 
342 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  27.4 
 
 
412 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  27.89 
 
 
443 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 
391 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 
395 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  30.95 
 
 
422 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.21 
 
 
412 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.25 
 
 
411 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.53 
 
 
412 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  24.89 
 
 
386 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  27.42 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
448 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  26.44 
 
 
412 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.64 
 
 
428 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.31 
 
 
384 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  32.02 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  30.48 
 
 
362 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  39.34 
 
 
358 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  21.01 
 
 
442 aa  45.4  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  30.77 
 
 
429 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>