44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1522 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 293 aa  590  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  37.71 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  31.54 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  31.8 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  31.73 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  31.45 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  28.24 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  23.15 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  22.3 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  21.62 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  22.8 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  23.92 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  20.55 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  21.77 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  23.33 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  23.45 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  21.23 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  21.66 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  22.67 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  22.13 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  21.66 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  20.89 
 
 		 385 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  19.03 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  24.12 
 
 		 417 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  20.07 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  18.45 
 
 		 552 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  20.09 
 
 		 426 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  19.87 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  21.05 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  21.05 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  22.54 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  20.89 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.89 
 
 		 384 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  21.8 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  19.63 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  21.62 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  22.18 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  21.18 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  20.74 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  20 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  18.38 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>