110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2280 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  80.37 
 
 
318 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  60.97 
 
 
327 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  65.71 
 
 
318 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  60.26 
 
 
318 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  44.34 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  36.28 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  40.53 
 
 
321 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  37.83 
 
 
417 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  39.87 
 
 
342 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  36.04 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  38.54 
 
 
317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  33.96 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  36.77 
 
 
329 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  37.58 
 
 
339 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  30.74 
 
 
323 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  40 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  36.25 
 
 
329 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  39.69 
 
 
361 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  38.06 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  39.06 
 
 
361 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  40.4 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  40.38 
 
 
333 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  39.01 
 
 
330 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  34.6 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  34.29 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  36.62 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  35.67 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  35.67 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  31.06 
 
 
337 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  35.67 
 
 
365 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  35.35 
 
 
365 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  35.35 
 
 
365 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  37.38 
 
 
341 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  37.99 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  36.21 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  37.12 
 
 
357 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  37.12 
 
 
357 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  36.77 
 
 
346 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  37.22 
 
 
346 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  36.08 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  35.87 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  36.7 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  34.91 
 
 
323 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  36.68 
 
 
372 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  36.53 
 
 
341 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  34.62 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  36.53 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  33.95 
 
 
337 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  33.75 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  32.89 
 
 
319 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  32.89 
 
 
319 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.19 
 
 
353 aa  122  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  28.15 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  34.8 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  36.42 
 
 
318 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.3 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  34.02 
 
 
362 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 
302 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  33.99 
 
 
314 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  24.38 
 
 
316 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  23.27 
 
 
316 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.29 
 
 
943 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.95 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  28.52 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  22.85 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  26.88 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.64 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  29.96 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  25.91 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  31.02 
 
 
442 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  21.02 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  37.86 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.9 
 
 
428 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  28.14 
 
 
442 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  30.82 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  28.05 
 
 
398 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  26.78 
 
 
395 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  36 
 
 
411 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.28 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.77 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  31.18 
 
 
552 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  27.6 
 
 
398 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  34.17 
 
 
453 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
431 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.73 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  30.04 
 
 
497 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  24.84 
 
 
257 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  23.51 
 
 
462 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  28.24 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  30.17 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  32.8 
 
 
369 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.32 
 
 
426 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  21.22 
 
 
389 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  37.14 
 
 
374 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  30.56 
 
 
402 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  27.5 
 
 
384 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>