117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02437 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  624  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  71.66 
 
 
314 aa  378  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  54.72 
 
 
319 aa  332  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  54.72 
 
 
319 aa  332  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  40.13 
 
 
326 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  39.94 
 
 
315 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  39.87 
 
 
357 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  39.87 
 
 
357 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  40.06 
 
 
352 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.14 
 
 
333 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  36.54 
 
 
317 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  34.75 
 
 
321 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  34.3 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  33.66 
 
 
327 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  35.44 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  34.59 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  35.81 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.48 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  28.1 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  37.75 
 
 
346 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.42 
 
 
317 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  30.96 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  30.9 
 
 
339 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  32.23 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  35.02 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  32.23 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  28.62 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.38 
 
 
353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  25.08 
 
 
323 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  30.85 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  28.04 
 
 
316 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 
323 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  30.7 
 
 
372 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.75 
 
 
355 aa  99  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.43 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  24.48 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  31.8 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  25.77 
 
 
417 aa  95.9  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  26.6 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.71 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.12 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  31.03 
 
 
361 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  29.38 
 
 
323 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.1 
 
 
329 aa  89.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.61 
 
 
943 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  31.37 
 
 
330 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  30.23 
 
 
354 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  28.06 
 
 
346 aa  86.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  30.41 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  25.48 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  28.03 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  30.09 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  27.83 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  29.54 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  29.54 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  29.54 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  29.54 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  29.54 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  26.84 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  21.76 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.5 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.64 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  21.39 
 
 
374 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  28.46 
 
 
384 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.59 
 
 
552 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  23.29 
 
 
363 aa  56.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  29.1 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.35 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.34 
 
 
428 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  36.94 
 
 
497 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  35.14 
 
 
392 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  24.53 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  48.15 
 
 
436 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  28.1 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.12 
 
 
399 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  27.69 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  34.21 
 
 
412 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.11 
 
 
421 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  23.77 
 
 
275 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  48.08 
 
 
429 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  31.73 
 
 
442 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 
395 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  34.92 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  31.43 
 
 
431 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.61 
 
 
426 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  24.58 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  25.81 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  37.04 
 
 
443 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.13 
 
 
442 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  37.5 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  32.74 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  44.68 
 
 
458 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  29.06 
 
 
431 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  33.94 
 
 
443 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  33.64 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>