101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0820 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  33.56 
 
 
321 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  32.81 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  34.55 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  32.76 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  33.79 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  33.96 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  30.98 
 
 
327 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  29.41 
 
 
349 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  28.23 
 
 
302 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  32.18 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  31.17 
 
 
333 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  33 
 
 
323 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  32 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  33.46 
 
 
318 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.46 
 
 
318 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  28.67 
 
 
316 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  30.45 
 
 
341 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.97 
 
 
323 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  27.8 
 
 
339 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  32.9 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  31.8 
 
 
336 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  28.72 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  23.74 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  29.03 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  29.31 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  26.47 
 
 
342 aa  92.4  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 
341 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  27.61 
 
 
417 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  29.63 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  30.42 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  26.3 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  28.28 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  24.22 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  27.78 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  30.18 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.34 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  23.95 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  27.63 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  26.9 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  26.9 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  28.12 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  23.61 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  26.76 
 
 
943 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  21.93 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  25.59 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  23.92 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.16 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  29.26 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  26.77 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  22.7 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  25.18 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.69 
 
 
412 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  26.22 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  26.05 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  24.2 
 
 
361 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  21.38 
 
 
353 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.73 
 
 
442 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  23.84 
 
 
361 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  24.56 
 
 
361 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  25.45 
 
 
365 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  25.45 
 
 
365 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  25.27 
 
 
365 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  21.5 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  25.09 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  25.09 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.25 
 
 
385 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.6 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  30 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  22.81 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.15 
 
 
428 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  21.12 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  21.12 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  20.08 
 
 
386 aa  45.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.53 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  40.43 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  30.39 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.45 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  35.38 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 
982 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.96 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  56.25 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  43.24 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  43.24 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  43.24 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  19.3 
 
 
407 aa  43.1  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  40 
 
 
519 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  24.85 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25.86 
 
 
380 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  46.34 
 
 
404 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>