69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4562 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  97.53 
 
 
365 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  98.36 
 
 
365 aa  737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  97.53 
 
 
365 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  72.41 
 
 
361 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  72.73 
 
 
361 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  74.34 
 
 
346 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  72.41 
 
 
361 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  66.57 
 
 
354 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  49.86 
 
 
372 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  55.94 
 
 
329 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  53.5 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  56.51 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  47.03 
 
 
417 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  55.21 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  52.2 
 
 
342 aa  279  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  34.42 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.88 
 
 
318 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  39.42 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35.26 
 
 
323 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  34.59 
 
 
327 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  35.35 
 
 
317 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.65 
 
 
318 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  31.76 
 
 
349 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  28.88 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  29.32 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  31.66 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  28.22 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  27.99 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  33.01 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
333 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  29.11 
 
 
315 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  26.4 
 
 
316 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  29.97 
 
 
321 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  27.27 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  27.86 
 
 
317 aa  93.6  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
323 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.38 
 
 
316 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  26.67 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  29.36 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.45 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  27.84 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  26.99 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  28.17 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  29.54 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  27.74 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  28.7 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  28.22 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  25.45 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  28.12 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  28.12 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.14 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  24.45 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  27.45 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  28.65 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  25.23 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  24.41 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  23.1 
 
 
275 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  22.35 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  21.58 
 
 
943 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  18.65 
 
 
293 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>