97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02556 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  777    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  29.2 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  27.59 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  29.29 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  26.19 
 
 		 326 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  28.28 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  30.09 
 
 		 342 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  32.34 
 
 		 338 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  27.59 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.86 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  26.26 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  31.71 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  25.53 
 
 		 327 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  27.3 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  30.95 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.6 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  30.68 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  27.1 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.33 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  24.92 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.81 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.81 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  25.66 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  24.46 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.89 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  28.53 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  28.53 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  26.54 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  25.97 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.94 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  23.15 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  26 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  25.44 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  23.74 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  26.18 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  26.2 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  26.33 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  23.95 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  24.26 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  24.26 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  22.87 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  25.74 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  23.68 
 
 		 316 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  23.19 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  24.13 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  24.05 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  22.88 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  25.16 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  23.21 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  21.74 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  21.8 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  23.56 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  25.23 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  24.29 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  25.23 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  19.16 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  24.02 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  18.69 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  23.1 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  22.56 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  24.26 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  25.32 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  25.29 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  24.86 
 
 		 943 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  24.09 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  28.86 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  17.36 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  27.08 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  21.71 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  20.93 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  22.09 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  23.93 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  23.17 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  21.95 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  26.12 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  21.51 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  22.56 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  23.13 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 		 422 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  22.12 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  23.01 
 
 		 491 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  24.32 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  21.74 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  24.07 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  24.07 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  24.21 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  24.07 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  22.08 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  24.37 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  24.24 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>