120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2449 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  62.94 
 
 		 327 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  60.69 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  65.71 
 
 		 317 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  61.59 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  36.68 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  43.04 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  42.11 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  42.05 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  37.19 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  35.03 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35.5 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  40.95 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  38.51 
 
 		 417 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  39.88 
 
 		 361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  41.08 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  39.57 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  39.26 
 
 		 361 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  39.31 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  37.14 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  37.46 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  37.77 
 
 		 365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  41.81 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  36.88 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  36.88 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  38.12 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  38.12 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  36.33 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.62 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  39.93 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  36.1 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  38.71 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  39.57 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  37.74 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  36.51 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  35.4 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  35.28 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  35.28 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  37.65 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  35.24 
 
 		 344 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  33.44 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  35.28 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  35.94 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  36.54 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  31.04 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  35.62 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  32.92 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  36.51 
 
 		 372 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  29.59 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  36.48 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  32.47 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  32.47 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  33.45 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  28.4 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  32.02 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  33.97 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  31.74 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  33.05 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  33.55 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.92 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  23.82 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.42 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  28.67 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.2 
 
 		 943 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  22.04 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  27.05 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  31.71 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.65 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  23.33 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.92 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  30.08 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  32.06 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  30.06 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.97 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.67 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.74 
 
 		 411 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.95 
 
 		 429 aa  53.1  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  26.22 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  36.79 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  22.31 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  25.51 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  31.4 
 
 		 552 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  30 
 
 		 442 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  25.38 
 
 		 407 aa  49.3  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  23.98 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.79 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  33.07 
 
 		 497 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.91 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  30.95 
 
 		 443 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  30.95 
 
 		 412 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.15 
 
 		 436 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  29.02 
 
 		 433 aa  45.8  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  29.73 
 
 		 399 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>