141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4604 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  750    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  28.86 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  28.49 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.8 
 
 		 294 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  24.29 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  22.98 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.05 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.59 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  23.71 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  28.38 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  24.86 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25.15 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  22.59 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  29.88 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  23.98 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  37.86 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  29.19 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  24.18 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  38.57 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.8 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  25.3 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  28.72 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  30.95 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  27.59 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  23.89 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  31.21 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  29.58 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  25.25 
 
 		 564 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  22.93 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  23.62 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.31 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  24.74 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  31.48 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  30.25 
 
 		 463 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  35.34 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  29.84 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  29.7 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  32.48 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  25.56 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.96 
 
 		 398 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  31.54 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 		 436 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  25.99 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  32.89 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.25 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  24.82 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.79 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.63 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.42 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  35.29 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  34.85 
 
 		 561 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  37.04 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  29.24 
 
 		 284 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.74 
 
 		 428 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  29.03 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  27.25 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  29.73 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.45 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  34.41 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  31.71 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  34.74 
 
 		 519 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  30.49 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  27.69 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.46 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  29.52 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  24.07 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  29.25 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  33.63 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  31.29 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  26.79 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  25.83 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  31.01 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.26 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  33.66 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  25.55 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  30.93 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  26.97 
 
 		 440 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  26.97 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  32.33 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.34 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  21.85 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  30 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  21.74 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.42 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>