88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1324 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 344 aa  689    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  46.1 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  38.1 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  36.89 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  38.41 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  39.45 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  38.71 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  36 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  36 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  38.06 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  34.93 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  33.22 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  36.45 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  37.58 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  36.33 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  36.83 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  34.46 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  36.81 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  33.44 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  32.6 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  35.35 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  37.29 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  32.1 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  33 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  34.44 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  34.44 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  33.23 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  33.23 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  33.55 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  32.18 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  32.55 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  30.97 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  31.25 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  35.44 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  34.26 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  26.07 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  27.01 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.75 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.1 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.92 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  24.68 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.83 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  27.53 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  23.34 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  27.1 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  29.24 
 
 		 943 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  24.09 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  23.95 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  26.18 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  25.73 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  26.46 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  27.43 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  25.8 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  25.48 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  25.16 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  25.48 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  25.82 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  25.82 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  26.97 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  26.04 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  26.04 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  24.11 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.11 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.36 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  26.24 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  26.91 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.29 
 
 		 552 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 		 519 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.36 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  33.9 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  34 
 
 		 982 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  28.95 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  34.91 
 
 		 411 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  26.95 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>