89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2518 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  46.28 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  39.54 
 
 
321 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  42.09 
 
 
323 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  37.96 
 
 
317 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  39.87 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  37.01 
 
 
315 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  33.12 
 
 
327 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  32.38 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  35.87 
 
 
346 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  32.69 
 
 
318 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.33 
 
 
318 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  30.87 
 
 
349 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  34.64 
 
 
319 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  34.64 
 
 
319 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  32.3 
 
 
357 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  32.3 
 
 
357 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  34.6 
 
 
317 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  33.04 
 
 
355 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  33.55 
 
 
344 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  35.03 
 
 
341 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  34.56 
 
 
372 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  32.68 
 
 
323 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  34.63 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  33.44 
 
 
337 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  34.71 
 
 
341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  31.13 
 
 
352 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  29.55 
 
 
323 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  30.51 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  32.78 
 
 
341 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  33.88 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  35.58 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.44 
 
 
318 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  34.3 
 
 
318 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  28.76 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  27.02 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  32.24 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.67 
 
 
323 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.55 
 
 
316 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  30.28 
 
 
362 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.12 
 
 
334 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  28.9 
 
 
302 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  27.62 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  26.16 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  27.87 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.54 
 
 
372 aa  95.9  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  27.06 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  26.49 
 
 
943 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  27.08 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  24.07 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  27.65 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  26.01 
 
 
417 aa  86.7  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 
267 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.6 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  27.27 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  27.27 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  26.61 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  26.96 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  26.96 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  27.49 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  27.19 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  28.1 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  26.59 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.58 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  22.56 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25.64 
 
 
412 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  25.99 
 
 
442 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  23.1 
 
 
552 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  22.67 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  27.01 
 
 
325 aa  52.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  22.54 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.48 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  23.99 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  24.87 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  28.44 
 
 
429 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  23.56 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  23.08 
 
 
462 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  26.05 
 
 
385 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  22.36 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  21.21 
 
 
402 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  23.35 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  24.41 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  25.13 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  23.38 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  24.56 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  29.41 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  22.66 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>