94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1117 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  643    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  643    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  54.72 
 
 
318 aa  309  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  55.52 
 
 
314 aa  285  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  38.8 
 
 
315 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  37.22 
 
 
333 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  34.88 
 
 
326 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  34.64 
 
 
316 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  32.88 
 
 
321 aa  149  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  36.3 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  33.97 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  33.12 
 
 
327 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  34.44 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  34.57 
 
 
352 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  33.64 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  33.64 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  32.33 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  31.91 
 
 
318 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  29.15 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  27.76 
 
 
349 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  32.47 
 
 
318 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  28.71 
 
 
344 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  28.67 
 
 
316 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  32.17 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  32.89 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  28.24 
 
 
316 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  31.83 
 
 
341 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  31.51 
 
 
341 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.48 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  33.44 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.91 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  32.56 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  31.58 
 
 
339 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.57 
 
 
355 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  31.23 
 
 
318 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  30.98 
 
 
372 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  26.67 
 
 
341 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  24.77 
 
 
353 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.62 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  29.64 
 
 
337 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  27.95 
 
 
342 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.34 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  24.48 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  26.4 
 
 
302 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  23.82 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  24.62 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.44 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.9 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  28.74 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  25.85 
 
 
943 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  27 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  22.16 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  29.41 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  26.59 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  29.41 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  26.59 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  28.12 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  28.12 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  26.59 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.88 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.75 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  20 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.63 
 
 
552 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  24.89 
 
 
276 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.16 
 
 
450 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.6 
 
 
428 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.4 
 
 
448 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  27.12 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.08 
 
 
443 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  23.13 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  27.14 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  26.32 
 
 
384 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  21.57 
 
 
446 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  30.77 
 
 
444 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  25.67 
 
 
424 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  37.04 
 
 
432 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  19.77 
 
 
462 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  30.69 
 
 
392 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.35 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.58 
 
 
411 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  37.04 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  24.39 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  23.76 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 
421 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.89 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.14 
 
 
458 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26.04 
 
 
564 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  24.46 
 
 
360 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  25.84 
 
 
384 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>