93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3625 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  64.22 
 
 		 346 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  51.26 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  45.74 
 
 		 357 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  45.74 
 
 		 357 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  39.49 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  41.04 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.48 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  37.42 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  37.97 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  36.89 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  36.22 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  32.38 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  36.28 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  36.36 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  37.03 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  36.33 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  35.96 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  37.78 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  35.96 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  35.76 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.8 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  32.57 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  37.66 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.51 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  36.83 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  36.94 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  35.02 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.08 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  34.09 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  35.59 
 
 		 362 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  33.97 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  33.97 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  29.82 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  33.79 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  31.27 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  35.9 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  29.34 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  34.08 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  29.94 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  34.28 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  30.29 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  27.3 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  28.12 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  29.02 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  28.26 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.52 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.43 
 
 		 943 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  24.38 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.66 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  28.66 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  29.54 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  28.97 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.45 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  26.56 
 
 		 365 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  28.66 
 
 		 361 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.48 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  26.56 
 
 		 365 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  26.56 
 
 		 365 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  28.35 
 
 		 361 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  26.4 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  26.4 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.15 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  32.42 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  21.86 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  29.44 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  27.83 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  31.36 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 		 428 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  23.46 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.4 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1427  hypothetical protein  27.17 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0646612  hitchhiker  0.0048399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  25.87 
 
 		 384 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  25.52 
 
 		 384 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  25.52 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.14 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 402 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  30.46 
 
 		 429 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  29.21 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  21.33 
 
 		 433 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  31.9 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.15 
 
 		 552 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.96 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  40.43 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  23.08 
 
 		 433 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  27.69 
 
 		 424 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  37.04 
 
 		 422 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  51.72 
 
 		 422 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  31.93 
 
 		 380 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>