40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1182 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  858    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  24.41 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  25.6 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  24.17 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  23.46 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  28.02 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  23.89 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  26.67 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  26.48 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  27.07 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  23.21 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  25.11 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  21.91 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  21.37 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  24.14 
 
 		 432 aa  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  24.56 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  26.09 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  27.78 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.86 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  25.69 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  31.94 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  20.9 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  25.93 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  36.84 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0580  hypothetical protein  27.34 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  41.38 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  31.51 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  36.46 
 
 		 275 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  30.23 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  21.93 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  22.87 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  37.1 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27.14 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  36.46 
 
 		 275 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  28.49 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  23.66 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  21.59 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  27.04 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  22.62 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>