36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3708 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  837    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  27.59 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  25.63 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  28.76 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  29.2 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.37 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  24.34 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  22.49 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  24.78 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  22.94 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  22.5 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  25.3 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  20.73 
 
 		 564 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  23.14 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  19.35 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  29.76 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  22.79 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  30.59 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  23 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  29.91 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  19.91 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  21.72 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 		 325 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  21.89 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  22.8 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  36.17 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  30.5 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  25.49 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  26.83 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  28.97 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  23.24 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  21.47 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  33 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.68 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  24.83 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>