80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2815 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  99.12 
 
 
341 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  73.27 
 
 
339 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  68.48 
 
 
372 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  64.26 
 
 
323 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  61.76 
 
 
344 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  60.24 
 
 
355 aa  362  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  61.29 
 
 
341 aa  358  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  60.12 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  55.38 
 
 
336 aa  309  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  44.13 
 
 
362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  39.55 
 
 
317 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  38.59 
 
 
321 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  36.21 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  38.67 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  35.96 
 
 
316 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  39.54 
 
 
323 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  35.03 
 
 
316 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  32.18 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  34.49 
 
 
327 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  37.54 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  36.19 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  36.19 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  35.94 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.97 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  34.43 
 
 
339 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  36.22 
 
 
352 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.53 
 
 
317 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  33.23 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  36.25 
 
 
346 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.09 
 
 
323 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  34.95 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  31.51 
 
 
319 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  32.23 
 
 
318 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  32.81 
 
 
318 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.07 
 
 
316 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.72 
 
 
323 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  24.38 
 
 
316 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.59 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  29.31 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  28.02 
 
 
417 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  27.46 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.36 
 
 
329 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  27.99 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.66 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  24.3 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  29.63 
 
 
330 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.1 
 
 
943 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.24 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  29.05 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  23.72 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  28.67 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  24.92 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  27.71 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.34 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  28.48 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  28.48 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.83 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.83 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.17 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  27.41 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.13 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  26.55 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  25.82 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  20.13 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  25.51 
 
 
257 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
552 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  31.61 
 
 
402 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.34 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.25 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.04 
 
 
458 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  28.93 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  23.62 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  27.47 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>