148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1118 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
391 aa  791    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  33.24 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  33.52 
 
 
404 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  33.24 
 
 
404 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  33.24 
 
 
404 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  32.69 
 
 
404 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  32.79 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  32.79 
 
 
405 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  33.24 
 
 
405 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  33.07 
 
 
404 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  29.86 
 
 
362 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  19.82 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.74 
 
 
442 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  20.25 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.42 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  25.47 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  24.47 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  27.6 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.86 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  19.94 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  22.19 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  23.05 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  26.42 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  24.35 
 
 
419 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  27.99 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.73 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  27.6 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  29.3 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  31.52 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  28.63 
 
 
489 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  25.99 
 
 
418 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  27.08 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  30.37 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2804  hypothetical protein  22.74 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3017  hypothetical protein  22.74 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  26.71 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  22.74 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2226  hypothetical protein  24.88 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000308564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3015  hypothetical protein  22.41 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2755  hypothetical protein  22.41 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  25.24 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  25.91 
 
 
451 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  29.11 
 
 
453 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  22.74 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.71 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  27.45 
 
 
422 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  34.07 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.17 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2736  hypothetical protein  22.07 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.68 
 
 
436 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3016  hypothetical protein  24.06 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  34.21 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21.69 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  33.66 
 
 
309 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.18 
 
 
444 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  29.65 
 
 
369 aa  52.8  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  27.56 
 
 
479 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.99 
 
 
552 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  26.34 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26.56 
 
 
564 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  29.24 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2816  hypothetical protein  23.12 
 
 
387 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  37.18 
 
 
421 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  30.83 
 
 
394 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  29.77 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  23.7 
 
 
432 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 
575 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  30.77 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.96 
 
 
297 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  22.75 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 
303 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.38 
 
 
463 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  24.72 
 
 
298 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 
267 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 
519 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  25.24 
 
 
333 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.51 
 
 
458 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  27.42 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  24 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  19.74 
 
 
379 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.81 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  30.09 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  23.08 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.56 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  23.63 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  29.73 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 
497 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  39.34 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  35.71 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  34.19 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  26.2 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>