166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2196 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
382 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  50.8 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  46.4 
 
 
395 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  48.6 
 
 
421 aa  323  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  48.58 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  45.6 
 
 
443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  45.77 
 
 
431 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  45.6 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  44.68 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  32.7 
 
 
407 aa  225  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  38.18 
 
 
453 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  35.67 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  34.26 
 
 
497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  34.4 
 
 
387 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  34.55 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  34.69 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.4 
 
 
399 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  31.6 
 
 
479 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  29.93 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  33.52 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  35.14 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  32.35 
 
 
564 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  36 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  30.07 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  25.54 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  33.19 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  33.73 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  30.4 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  28.27 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.57 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  32.75 
 
 
561 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  29.63 
 
 
451 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  27.14 
 
 
463 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  38.62 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27.05 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  31.4 
 
 
419 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.32 
 
 
432 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  27.56 
 
 
552 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  33.98 
 
 
439 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  30.15 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  31.38 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  29.86 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  27.24 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  28.5 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  32.49 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.64 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  37.96 
 
 
432 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  31.84 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 
491 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  27.12 
 
 
401 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  35.71 
 
 
473 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.42 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.41 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.42 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  36.05 
 
 
325 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  25.73 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  36 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.42 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  34.06 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  32.96 
 
 
440 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  29.27 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  33.93 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.42 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  31.18 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  29.86 
 
 
449 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  29.86 
 
 
449 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  29.05 
 
 
449 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  29.22 
 
 
469 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  28.34 
 
 
428 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  33.06 
 
 
437 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 
385 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  28.38 
 
 
333 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.27 
 
 
302 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  31.43 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.68 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  24.68 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  34.34 
 
 
290 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  23.84 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  29.77 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  23.66 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  25.2 
 
 
391 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.14 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  46.3 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  33.07 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  37.18 
 
 
391 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  25.32 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  37.6 
 
 
436 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  29.21 
 
 
443 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.67 
 
 
296 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  29.79 
 
 
430 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  41.54 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>