55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3550 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  100 
 
 
530 aa  1033    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  54.59 
 
 
436 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  39.24 
 
 
445 aa  259  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  34.37 
 
 
487 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  35.7 
 
 
445 aa  213  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  35.08 
 
 
505 aa  200  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 
652 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  33.41 
 
 
451 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  35.53 
 
 
469 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  35.06 
 
 
684 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  34.99 
 
 
641 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  32.78 
 
 
528 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  34.44 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  34.93 
 
 
448 aa  174  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  32.48 
 
 
638 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  35.15 
 
 
828 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  31.66 
 
 
638 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.23 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.38 
 
 
419 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  31.48 
 
 
455 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  23.45 
 
 
446 aa  63.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  29.02 
 
 
404 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 
435 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.83 
 
 
436 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 
446 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  27.46 
 
 
449 aa  57  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.36 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.2 
 
 
440 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.18 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 
444 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  26.79 
 
 
405 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  26.23 
 
 
440 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  25.66 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  36.99 
 
 
310 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 
296 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.62 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  32.03 
 
 
298 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  24.9 
 
 
429 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.08 
 
 
458 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  35.51 
 
 
489 aa  47.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  32.56 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 
519 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 
340 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  27.43 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.09 
 
 
340 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  35.94 
 
 
288 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  31.12 
 
 
399 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  32.31 
 
 
241 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  25 
 
 
408 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  25 
 
 
408 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  24.52 
 
 
408 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.49 
 
 
303 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.7 
 
 
444 aa  43.5  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>